| Selbsterneuerung und Differenzierung von Stammzellen | Maintenance and Differentiation of Stem Cells in Development und Disease | | 30.06.2022 / 3rd funding period | |
| Zelluläre Qualitätskontrolle und Schadensbegrenzung | Cellular Surveillance and Damage Response | | 30.06.2021 / phase out financing | |
| Integrative Analyse der Replikation und Ausbreitung pathogener Erreger | Integrative Analysis of Pathogen Replication and Spread | Prof. Dr. Hans-Georg Kräusslich | | |
| Funktionelle "ensembles": Integration von Zellen, Genese von Aktivitätsmustern und Plastizität von Gruppen ko-aktiver Neurone in lokalen Netzwerken | Functional ensembles: cellular components, patterned activity and plasticity of co-active neurons in local networks | Prof. Dr. Andreas Draguhn | | |
| Von der Nozizeption zum chronischen Schmerz: Struktur-Funktions-Merkmale neuraler Bahnen und deren Reorganisation | From Nociception to Chronic Pain: Structure-function Properties of Neural Pathways and Their Reorganisation | | 1st funding period ends 30.06.2023 / 2nd funding period | |
| Mechanismen und Funktionen des Wnt-Signalwegs | Mechanisms and functions of WnT signaling | Prof. Dr. Michael Boutros | 30.06.2025 / 2nd funding period | |
| Vascular Control of Organ Function | Vascular Control of Organ Function | Prof. Dr. Helmut Augustin | 31.12.2022 / 1st funding period | |
| Molecular Architecture and Cellular Functions of Lipid/Protein Assemblies | Molecular Architecture and Cellular Functions of Lipid/Protein Assemblies | | | |
| Determinanten und Dynamik der Elimination versus Persistenz bei Hepatitis-Virus-Infektionen | Determinants and Dynamics of Elimination versus Persistence of Hepatitis Virus Infection | Prof. Dr. Ralf Bartenschlager | ends 2024 / 2nd funding period | |
| Molekulare Schalter zur räumlichen und kinetischen Regulation der zellulären Signaltransmission | Molecular Switches in the Spacio-temporal Control of Cellular Signal Transmission | Prof. Dr. Christian Freund | ends 2024 / 2nd funding period | |
| RMaP: RNA Modifikation und Prozessierung | RMaP: RNA Modifikation und Processierung | | | |
| Molekulare Schaltkreise von Herzerkrankungen | Molekulare Schaltkreise von Herzerkrankungen | | | |